SigmaNEST jest w dużym stopniu zintegrowany z wiodącymi programami 3D typu CAD/CAM. Mając dostęp do natywnych plików łączy się w tle z danym środowiskiem projektowym, rozkłada model cienkościenny 3D części, blachy lub złożenia na płaskie kształty i importuje je do SigmaNEST. W programie można ustawić opcję nie czytania i rozkładania części znormalizowanych np. nakrętki, śruby i itp. Dodatkowo program pozwala na przetworzenie informacji zagnieżdżonych w plikach natywnych takich jak: materiał, grubość, ilość, klient, autor.